Cette technique sera utilisée pour comparer les variances de deux échantillons de tailles différentes. L'hétérogénéité des variances des échantillons de l'expérience invalide les comparaisons des moyennes. Une solution possible est de transformer les données (par exemple X'= log(x)).

Dans le cas où l'expérience contient plus de deux échantillons, on emploiera la technique de Hartley, mais à la seule condition que les échantillons soient de même taille.

Le rapport de deux variances (carrés moyens) calculé dans une ANOVA se teste également par une variable de Fisher. Par exemple:

Fobs = CMfactoriel / CMrésiduel

Qui est aussi une valeur F de Fisher-Snedecor pour k et r degrés de liberté tels que:

• k = nombre de degrés de liberté du niveau expliqué analysé (na-1 avec na le nombre d'échantillons comparés)
• r = N-na (avec N le nombre total d'individus de l'expérience et na le nombre d'échantillons comparés)

Comme précédemment, si le Fobs est supérieur au F théorique, il y a RH0.